La città di Siponto è stata importantissima in epoca romana per il suo porto.
Un violento terremoto ha raso al suolo la cittadina nel 1223.
Prima del recente restauro, il sito archeologico di Siponto consisteva nella Basilica di santa Maria maggiore (stile romanico Pugliese) e i resti della pavimentazione della chiesa paleocristiana. Sui resti della chiesa paleocristiana è stata realizzata una chiesa tridimensionale. La tecnica usata prevede l’uso di reti metalliche intrecciate tra loro.